沖之鳥事件引發台日關係緊張。外交部長林永樂上午召見日本駐台代表沼田幹夫，當面向他強調我方的嚴正立場。雖然日方提出2005、2012年我國曾兩度付款贖船並未抗議，但林永樂還是強調，沖之鳥不是島，沒有主張經濟海域的權力。對此行政院長張善政也警告日本，柿子不要挑軟的吃。
