彭婉如命案雖然有重大突破，但要破案，還得克服許多困難，因為19年前，高雄的監視器不多，而且畫面也有些模糊，還有相關證物要完整保存19年，也是難上加難，加上當初DNA技術不成熟，因此可能漏掉其他可以採集的跡證，最後，警方當時鎖定計程車司機進行清查，但還是沒有進一步消息，難道是因為鎖定範圍太狹窄，導致有落網之魚嗎？
彭婉如命案雖然再現曙光，但還是困難重重。資深媒體人丁學偉表示「這個案子很難破，一直遇到膠著、一直遇到瓶頸，因為當初監視器沒有那麼多，目擊者看到的就是說，彭婉如那天拖著行李箱就出了尖美飯店，而且她是跟朋友講說她要到圓山飯店去，可是這中間的過程中沒有人看到。」
十九年前監視器不如現在，在高雄監視器設置並不多，而且畫質也有些模糊，無法清楚拍下計程車車牌，加上當時天色昏暗，因此沒有清楚看見彭婉如坐上計程車離開，只隱約看見她舉起手，但是舉手是要攔車還是跟朋友打招呼，沒人能夠百分之百確定。資深媒體人丁學偉：「雖然有一枚血掌紋，可是那個血掌紋是側面，這個側面所以他不是很清楚，另外有在她的皮包她的隨身物品的皮包上面採集到一枚指紋，那個指紋也不是很清晰，其實DNA是很準的，那只是說因為當初DNA比對，還沒有運用的那麼廣，所以那個時候在現場蒐證的時候，就會喪失掉一些跡證。
事發當時警方採集到的是側面掌紋，還有不清晰的指紋模糊不清，已經有所難度再加上事隔十九年，要完整保存更是難上加難，而且當時DNA技術不成熟，也可能因此喪失其他可以採集的跡證。資深媒體人丁學偉：「依照刀子傷口的深淺還有傷痕的長度，不大有可能是在密閉的計程車裡面犯案，應該是在空曠的地方，追砍或者是用力砍，所以後來整個案情就陷入膠著，警方才發現說啊，是不是一開始鎖定計程車司機犯案是個錯誤。」彭婉如總共被狠砍35刀，光在背部就有32刀，疑似被追砍，如果是運將臨時起意的話，不太可能會狂砍這麼多刀，警方懷疑35刀是充滿恨意的，很有可能是仇家，但當時卻只鎖定計程車運將進行清查，恐怕會有漏網之魚，如今19年過去了，雖然案情出現曙光想撥雲見日，還有重重的困難得先克服。
