金正男遭到毒殺，誰是幕後黑手？目前大都指向他的胞弟金正恩。不過各種陰謀論也不斷傳出，其中有人懷疑南韓政府是幕後黑手，目的是為了轉移閏密案醜聞的注意力。另外也有陰謀論指向日本，因為日本為了報復北韓射導彈，藉由暗殺金正男引發北韓政治內訌。
金正男離奇命喪吉隆坡機場，凶嫌來自不同國家，現在陰謀論四起，誰才是幕後凶手？有人說整起事件是南韓一手策畫，因為沒有人比南韓更希望北韓陷入混亂。在馬國公布金正男遇刺事件前，南韓首先發佈消息，希望引爆北韓政治鬥爭，另外有陰謀論指出，金正男其實是朴槿惠和金正恩的內線，南韓封口而將他殺害。另外朴槿惠也可能為了轉移彈劾審判，擺脫崔順實門醜聞的注意力和三星電子副會長李在鎔聯手策畫，派人前往朝鮮，要求金正恩暗殺金正男。
外界把凶手都指向北韓，所以如果北韓被證實，這次真的是它痛下毒手的話，北韓很有可能被列為恐怖國家。韓聯社引述消息人士指出，由於金正男獲得了已遭金正恩殺害的姑丈張成澤控制的秘密資金，以及繼承了父親金正日大量財產，而北韓因為多次發射導彈，面臨財政困難，因此金正恩要求金正男帶著錢返回北韓，但遭到拒絕，因此痛下殺手。此外金正男也曾多次發表對金正恩不滿，並公開批評及質疑他的能力，造成金正恩心生不滿，決定除之而後快。
