柯文哲遭收押禁見，有兩個重要原因，其中之一就是檢方提出事證，質疑柯文哲妻小帳戶有不明金流，而金流的走向有待進一步釐清，甚至可能轉成「賄賂罪」。還有一點，就是涉嫌滅證。還記得8月30日柯文哲住家被搜索當天嗎？他明明就在家裡，卻遲遲不應門。後來檢方檢視柯文哲手機，發現在那段時間，他疑似在刪除對話紀錄。
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搜索當天走出家門，柯文哲說他坦蕩蕩，但根據已曝光的地院裁定書揭露，搜索時所扣押的柯文哲手機，已有對話紀錄遭刪除的痕跡，恐有串聯其他潛在共犯的事證。這是滅證還是畏罪？柯文哲都相當可疑。8月30日當天上午6:30，檢察官帶隊到柯文哲家，行動一度受阻無人應門。一個小時後才有人開門，這段時間柯文哲夫妻在拖延什麼？檢方後來從他的手機發現，疑似有訊息被刪除，懷疑就是這段時間，他忙著狂按delete鍵，想刻意隱藏什麼？老婆小孩的帳戶，是另一個羈押關鍵。
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調查發現，陳佩琪曾多次拿百萬現鈔到ATM存款，儘管她說這是她的『理財方式』，但還是引起檢方的高度質疑。為什麼這筆錢不臨櫃存款呢？還是想要藉此逃避申報？或是相關的不明金流已經轉往海外帳戶？
裁定收押禁見的原因，點出柯文哲配偶和子女帳戶疑似有不明金流，而柯文哲的兒子人在日本東京帝國大學攻讀博士班，不只台灣帳戶鎖定調查，日本海外帳戶也要追查。裁定書還寫到，隨證據及資料獲得，逐漸形成具體的犯罪輪廓，甚至轉成「賄賂罪」重刑。外傳柯文哲知道檢察官在辦京華城案後，還跟沈慶京見面，更被法官認為不能再讓柯文哲交保或請回，裁定收押禁見。
「報導本於目前偵辦進度與披露資訊，任何人在依法被判決有罪確定前，均應推定為無罪」
