遭飛彈擊中的高雄籍漁船翔利昇，連同船長的遺體已經被拖回興達港，究竟為何發生船難？國防部昨天下午召開記者會證實，是「人為疏失」，造成飛彈誤擊，左右貫穿漁船，導致造成一死三傷的船難，行政院長林全，也派副院長南下處理，根據國防部公布的最新名單內，包括海軍司令及其他艦長軍官士官，共七人遭記過處分，雄檢偵訊後，射控士官長陳銘修和誤擊發飛彈的中士高嘉駿，各30萬元交保，艦長和中尉兵器長許博為分別請回。
遭飛彈擊中的高雄籍漁船「翔利昇」號，連同船長遺體被拖回興達港，船身已經面目全非，尤其在船尾部分，左後側出現塌毀和碎裂痕跡，駕駛艙還出現大破洞。
家屬一早接到兒子由漁船上打來的求救電話時，大家嚇了一大跳，漁船前一天才出海到澎湖海域捕明蝦，怎麼會突然出事？死亡船長黃文忠長子說，早上媽媽接到電話說「漁船爆炸、爸爸死了、船要沉了」心急如焚，急著通報海巡救人，根本沒時間問出了什麼事。船長的妻子聽到噩耗趕到興達港，船長家人看到殘破不堪的漁船，哭到跪在地上。
國防部副部長李喜明表示，從外觀上面來看，並沒有燒灼或是爆炸的痕跡，因為漁船的上層結構很脆弱，感覺只是凸穿，並沒有一些燒痕或是爆炸痕跡。
高雄市地檢署襄閱主任檢察官黃元冠表示，經過法醫利用移動式X光機進行相關傷勢檢驗，檢驗的初步結果，主要傷勢是黃姓船長的頭部以及左手部，有非常嚴重的開放性及粉碎性骨折，頭髓有嚴重受損的情況，身上布滿非常多相似的金屬材質的碎片，那是有金屬遭受高速高動能的衝擊，使金屬碎裂所致。
按照軍方說法，飛彈當時是從船尾部分左右貫穿，也就是說，雄三飛彈是與海面平行，擊中並貫穿漁船後墜海，而根據國防部的說法，雄三飛彈發射後，會針對目標區域進行搜索，漁船剛好就在原先假設的區域上，因而遭到雄三飛彈鎖定。
同在船上的船長兒子指出，飛彈發射過來的時候，爸爸在駕駛艙，三名船員在睡覺，因此幸運逃過一劫，都只受到輕傷，他們發現出事的時候，趕緊打電話回家求救，原本他們以為只是單純的意外，後來聽說是被飛彈射中，家屬相當不能接受，對於親人的驟逝，都相當悲痛，跪地痛哭。對於國防部證實漁船事遭到飛彈打中的事實，船長家屬也痛罵：「還我爸爸來！」
原本保衛國人的國軍，竟然因為誤射造成人死亡，行政院長林全也表示難過和抱歉，希望國軍能夠對此檢討，國防部晚間也已經公布七名相關人員的懲處名單。
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