審計部指出，海軍多項裝備面臨零件短缺與故障問題，專家憂心主力戰艦老舊、新艦銜接未明，建議以無人載具補足反潛戰力。
2025年中央政府總決算審核報告公布後，海軍艦隊老化與海防能力是否出現隱憂，再度引發關注。據了解，包括紀德級艦配置的標準二型（SM-2）飛彈系統，部分關鍵零組件已無庫存；另外，新造玉山級船塢運輸艦服役不久卻故障頻傳，海上防禦與反潛戰力的維持，受到外界檢視。
國防部7月實施聯合防禦操演，東指部針對綠島、蘭嶼進行防禦工事及機動陣地等操演，尤其蘭嶼部分，被指是近30年來首見軍方登島演練。有學者分析，共軍若奪下東部離島，有可能作為火箭彈、無人機與直升機基地。
國防安全研究院副研究員舒孝煌：「過去沒有考慮過這種問題，以前共軍的武力投射能力，特別是海上，並沒有那麼強，但現在有了075、076兩棲攻擊艦，萬一已經攻佔島嶼，並設立前進基地，甚至奪占機場，因為蘭嶼、綠島都有機場，那我們就需要有一些比較遠距離的武力投射能力。」
針對審計部報告點出的裝備妥善率與商源問題，內容提到紀德級艦的標準二型飛彈系統等多項裝備，面臨商源消失；新造玉山級船塢運輸艦則在服役不久後出現故障頻傳情況。海軍回應表示，上述裝備妥善率目前均能滿足任務需求，但也承認艦隊老化問題確實存在。
國防安全研究院副研究員舒孝煌：「第一優先汰換的是濟陽級巡防艦，因為已經非常老，而且它使用的是鍋爐系統，屬於消失性商源，已經沒有辦法維修了。」
對於未來建軍方向，軍事專家陳國銘認為，現階段新一代主力戰艦銜接仍不明確。
軍事專家陳國銘：「我們下一代主力戰艦，其實目前還沒有著落，可能是預算接不上，或造艦期程跟不上。或許要思考海軍未來的戰略，是否還需要這麼多大型艦艇。俄烏戰爭期間，我們看到烏克蘭利用小型無人艇與反艦飛彈，重創黑海艦隊。」
目前海軍一線主力戰艦中，無論基隆級驅逐艦或成功級巡防艦，服役都已超過25年。在海軍艦隊老化壓力下，專家建議，可先以無人載具補足反潛戰力，作為海上兵力運用的調整方向。面對局勢持續變化，國軍如何穩定戰力並提升應變能力，仍待進一步驗證。
