受到山陀兒影響，離島地區 綠島、蘭嶼，風雨交加，從9月29日晚間，風雨就逐漸增強，綠島地區大雨挾帶土石，直接形成「天然小河」，甚至山壁也出現「瀑布」；而蘭嶼，這次成為全台第一個放颱風假的地區，當地居民表示，因為大家經歷過小犬颱風，早就提前做好防颱準備，希望不要釀成太大災情。
滾滾泥水從高處留下來，颱風外圍環流，帶來間接性大雨，讓綠島出現雨水挾帶泥沙 ，從山區流向道路。綠島地區風雨交加，狂風加上暴雨，雨完全是斜著在下，一旁路樹也都被吹的左搖右晃，走在路上幾乎看不清前方道路。
綠島潛水教練阿志：「再晚一點的話，海邊的浪，風浪，浪高可能會到八米左右，八米就大概是兩層樓那麼高，昨天開始就已經停船了，所以遊客基本上也進不來。」
大量雨水從高處傾瀉而下，居民表示平常下雨就會這樣，但這次颱風帶來大雨，居然直接形成天然瀑布 。綠島居民做好萬全準備，店家把生財工具，機車、潛水用具等等，都提前收好，就怕颱風 造成嚴重損害。
而同樣在離島，蘭嶼沿岸地區，海浪不斷拍打上岸，激起大片浪花，完全沒有人出現在岸邊，民眾也只敢乖乖待在家裡。29號入夜後，風雨逐漸增強，蘭嶼是全台，第一個放颱風假的地區，9/30 停班停課。
蘭嶼民宿業者李老闆：「雨勢都一陣有一陣沒有，昨天晚上是突然有下暴雨，暴雨的量是有聽到，鄉民有一些小災情，因為去年大家經歷過小犬所以滿多人，可能大概前天，大前天 就很擔心，就已經開始在做了。」
蘭嶼居民們有備無患，提前做好防颱準備，在窗戶上貼膠帶，希望能降低山陀兒颱風，帶來的災情損害。
