受到強震衝擊，台南科學園區受創也很嚴重，多數廠房磁磚剝落，園區水管還大爆裂，幸好緊急修復，用水量大的聯電晶圓廠差點損失數十億元，此外還有一間玻璃工廠也很慘，地震當時廠房內55公噸的玻璃全部掉落砸碎，畫面看得讓人怵目驚心。
