衛福部國健署新任署長王英偉，打算推動菸捐漲20元來到40元，及菸稅漲5元來到21.8元政策，調整後，國內平均每包菸將破百元，比吃一餐便當還要貴。
不過健康捐的運用成效如何？根據審計部資料顯示，部分獲配健康捐執行率長期都在8成以下，統計至今已累積106億未獲妥善運用！過去菸品健康捐的流向未公開透明且未受監督，常被外界戲稱為國健署的「小金庫」。根據菸品健康捐分配及運作辦法規定，每年收得健康捐50%需供全民健保之安全準備，其餘提供菸農輔導、罕見疾病醫療，以及補助醫療資源貧乏地區計畫，不過審計部資料顯示，其中「菸農及產業輔導」項目款項累積近8億元待運用，自101年以來執行率不到1%。
而菸捐補助的資訊揭露也參差不齊，時代力量立委徐永明表示，上調菸品價格與稅收是國際趨勢，但是國健署在菸捐運用上應針對補助項目浮濫、內容不清楚再進行檢討，資料顯示有大量補助金額僅以「補助民眾」概稱，甚至用作補貼健保財政缺口，運作上既不透明也無法有效監督，他認為菸品稅捐應朝捐稅合一方向考量，達到透明監督之效。
資料顯示，台灣目前每包菸平均價格逼近百元，菸價僅是香港和美國的三分之一。而菸捐經過幾度調漲後，根據國健署去年吸菸率調查，國人吸菸率由103年16.4%微幅增加升到17.1%，換句話說，吸菸人口竟在去年逆勢上漲17萬人，是7年來首度上升，顯示相關措施並未快速達到制衡吸菸人口的效果。
對此，董氏基金會菸害防治組主任林清麗指出，根據世界衛生組織WHO建議，當菸稅占總菸價67~80％時，能達到以價制量、國庫稅收增加以及防止走私菸氾濫等目的，若以台灣現行的菸價來看，菸稅應調漲60元、才能來到國際低標的67％，「希望修法能一次到位，不要只是菸稅調5元、總價調25元這樣慢慢調」。
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